Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN3P26045 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN3P26045 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN3P26045 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms