Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms