Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDCP19113 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDCP19113 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDCP19113 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDCP19113 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDCP19113 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDCP19113 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDCP19113 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDCP19113 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDCP19113 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDCP19113 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDCP19113 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDCP19113 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HDCP19113 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDCP19113 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDCP19113 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDCP19113 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDCP19113 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDCP19113 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDCP19113 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDCP19113 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDCP19113 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDCP19113 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HDCP19113 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HDCP19113 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDCP19113 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDCP19113 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDCP19113 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDCP19113 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDCP19113 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDCP19113 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDCP19113 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDCP19113 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDCP19113 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDCP19113 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDCP19113 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDCP19113 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDCP19113 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDCP19113 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDCP19113 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDCP19113 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDCP19113 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDCP19113 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HDCP19113 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDCP19113 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDCP19113 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDCP19113 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDCP19113 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDCP19113 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDCP19113 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDCP19113 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDCP19113 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDCP19113 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDCP19113 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDCP19113 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HDCP19113 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDCP19113 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDCP19113 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDCP19113 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDCP19113 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDCP19113 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDCP19113 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDCP19113 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDCP19113 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDCP19113 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDCP19113 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HDCP19113 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDCP19113 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDCP19113 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDCP19113 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDCP19113 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HDCP19113 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDCP19113 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDCP19113 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDCP19113 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDCP19113 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDCP19113 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HDCP19113 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDCP19113 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDCP19113 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDCP19113 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HDCP19113 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDCP19113 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDCP19113 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDCP19113 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDCP19113 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDCP19113 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDCP19113 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDCP19113 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDCP19113 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDCP19113 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDCP19113 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDCP19113 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDCP19113 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDCP19113 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDCP19113 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDCP19113 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDCP19113 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDCP19113 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDCP19113 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms