Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXB8P17481 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB8P17481 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms