Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCL2P13500 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCL2P13500 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCL2P13500 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCL2P13500 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCL2P13500 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCL2P13500 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCL2P13500 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCL2P13500 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCL2P13500 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL2P13500 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL2P13500 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL2P13500 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL2P13500 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL2P13500 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL2P13500 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL2P13500 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL2P13500 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL2P13500 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL2P13500 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL2P13500 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL2P13500 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL2P13500 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL2P13500 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL2P13500 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL2P13500 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL2P13500 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL2P13500 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL2P13500 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL2P13500 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL2P13500 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL2P13500 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL2P13500 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL2P13500 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL2P13500 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL2P13500 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL2P13500 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL2P13500 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL2P13500 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL2P13500 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL2P13500 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL2P13500 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL2P13500 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL2P13500 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL2P13500 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL2P13500 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL2P13500 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL2P13500 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL2P13500 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL2P13500 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL2P13500 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL2P13500 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL2P13500 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL2P13500 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL2P13500 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL2P13500 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL2P13500 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL2P13500 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL2P13500 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL2P13500 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL2P13500 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL2P13500 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL2P13500 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL2P13500 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL2P13500 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL2P13500 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL2P13500 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL2P13500 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL2P13500 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL2P13500 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL2P13500 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL2P13500 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL2P13500 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL2P13500 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL2P13500 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL2P13500 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL2P13500 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL2P13500 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL2P13500 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL2P13500 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL2P13500 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL2P13500 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL2P13500 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL2P13500 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL2P13500 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL2P13500 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL2P13500 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL2P13500 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms