Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLUP10909 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLUP10909 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLUP10909 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLUP10909 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLUP10909 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLUP10909 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLUP10909 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLUP10909 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLUP10909 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLUP10909 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLUP10909 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLUP10909 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLUP10909 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLUP10909 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLUP10909 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLUP10909 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLUP10909 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLUP10909 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLUP10909 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLUP10909 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLUP10909 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLUP10909 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLUP10909 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLUP10909 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLUP10909 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLUP10909 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLUP10909 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLUP10909 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLUP10909 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLUP10909 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLUP10909 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLUP10909 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLUP10909 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLUP10909 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLUP10909 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLUP10909 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLUP10909 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLUP10909 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLUP10909 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLUP10909 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLUP10909 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLUP10909 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLUP10909 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLUP10909 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLUP10909 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLUP10909 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLUP10909 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLUP10909 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLUP10909 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLUP10909 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLUP10909 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLUP10909 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLUP10909 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLUP10909 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLUP10909 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLUP10909 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLUP10909 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLUP10909 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLUP10909 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLUP10909 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLUP10909 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLUP10909 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLUP10909 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLUP10909 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLUP10909 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLUP10909 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLUP10909 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLUP10909 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLUP10909 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLUP10909 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLUP10909 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLUP10909 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLUP10909 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLUP10909 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLUP10909 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLUP10909 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLUP10909 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLUP10909 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLUP10909 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLUP10909 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLUP10909 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLUP10909 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLUP10909 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLUP10909 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLUP10909 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLUP10909 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLUP10909 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLUP10909 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLUP10909 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLUP10909 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLUP10909 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLUP10909 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLUP10909 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLUP10909 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLUP10909 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLUP10909 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLUP10909 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLUP10909 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLUP10909 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.3 ms