Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VSIG8P0DPA2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSIG8P0DPA2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSIG8P0DPA2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.1 ms