Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC166P0CW27 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC166P0CW27 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC166P0CW27 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms