Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC172P0C7W6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC172P0C7W6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC172P0C7W6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms