Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP3A4P08684 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP3A4P08684 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP3A4P08684 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP3A4P08684 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP3A4P08684 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms