Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGGP02679 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGGP02679 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGGP02679 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGGP02679 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGGP02679 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGGP02679 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGGP02679 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGGP02679 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGGP02679 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGGP02679 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGGP02679 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGGP02679 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FGGP02679 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGGP02679 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FGGP02679 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGGP02679 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGGP02679 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGGP02679 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGGP02679 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGGP02679 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGGP02679 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGGP02679 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGGP02679 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGGP02679 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGGP02679 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGGP02679 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGGP02679 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FGGP02679 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGGP02679 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGGP02679 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGGP02679 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGGP02679 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGGP02679 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGGP02679 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGGP02679 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGGP02679 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGGP02679 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGGP02679 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FGGP02679 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGGP02679 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGGP02679 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGGP02679 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGGP02679 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGGP02679 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGGP02679 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGGP02679 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGGP02679 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGGP02679 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FGGP02679 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGGP02679 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGGP02679 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGGP02679 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGGP02679 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FGGP02679 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGGP02679 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FGGP02679 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGGP02679 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGGP02679 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGGP02679 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGGP02679 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FGGP02679 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGGP02679 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGGP02679 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGGP02679 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGGP02679 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGGP02679 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGGP02679 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGGP02679 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGGP02679 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGGP02679 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGGP02679 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGGP02679 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGGP02679 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FGGP02679 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGGP02679 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGGP02679 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGGP02679 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGGP02679 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGGP02679 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGGP02679 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGGP02679 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FGGP02679 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGGP02679 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGGP02679 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGGP02679 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGGP02679 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGGP02679 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGGP02679 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGGP02679 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGGP02679 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FGGP02679 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGGP02679 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGGP02679 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGGP02679 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGGP02679 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGGP02679 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGGP02679 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGGP02679 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGGP02679 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms