Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VIPP01282 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIPP01282 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VIPP01282 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPP01282 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPP01282 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPP01282 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPP01282 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPP01282 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPP01282 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPP01282 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPP01282 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIPP01282 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIPP01282 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIPP01282 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VIPP01282 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIPP01282 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIPP01282 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VIPP01282 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIPP01282 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPP01282 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPP01282 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPP01282 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPP01282 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPP01282 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VIPP01282 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VIPP01282 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VIPP01282 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VIPP01282 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VIPP01282 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIPP01282 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIPP01282 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIPP01282 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIPP01282 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPP01282 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPP01282 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPP01282 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPP01282 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPP01282 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPP01282 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPP01282 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPP01282 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPP01282 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPP01282 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPP01282 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPP01282 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPP01282 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPP01282 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPP01282 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIPP01282 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIPP01282 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIPP01282 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIPP01282 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIPP01282 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIPP01282 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIPP01282 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIPP01282 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIPP01282 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIPP01282 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIPP01282 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIPP01282 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIPP01282 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIPP01282 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIPP01282 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VIPP01282 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VIPP01282 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VIPP01282 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIPP01282 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIPP01282 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPP01282 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPP01282 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPP01282 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPP01282 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPP01282 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPP01282 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPP01282 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPP01282 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPP01282 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPP01282 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIPP01282 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIPP01282 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VIPP01282 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIPP01282 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VIPP01282 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIPP01282 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIPP01282 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIPP01282 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIPP01282 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIPP01282 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIPP01282 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIPP01282 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIPP01282 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VIPP01282 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIPP01282 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIPP01282 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIPP01282 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VIPP01282 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIPP01282 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPP01282 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPP01282 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms