Protein–RNA interactions for Protein: O95718

ESRRB, Steroid hormone receptor ERR2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRBO95718 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ESRRBO95718 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ESRRBO95718 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESRRBO95718 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESRRBO95718 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESRRBO95718 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESRRBO95718 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESRRBO95718 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESRRBO95718 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESRRBO95718 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ESRRBO95718 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ESRRBO95718 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESRRBO95718 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ESRRBO95718 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRBO95718 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRBO95718 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRBO95718 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRBO95718 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRBO95718 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRBO95718 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRBO95718 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRBO95718 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ESRRBO95718 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ESRRBO95718 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ESRRBO95718 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms