Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LCA5LO95447 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCA5LO95447 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCA5LO95447 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.9 ms