Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LTN1O94822 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LTN1O94822 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LTN1O94822 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LTN1O94822 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LTN1O94822 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LTN1O94822 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
LTN1O94822 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LTN1O94822 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LTN1O94822 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LTN1O94822 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LTN1O94822 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LTN1O94822 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LTN1O94822 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.76■■■■□ 3
LTN1O94822 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTN1O94822 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
LTN1O94822 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTN1O94822 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTN1O94822 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTN1O94822 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTN1O94822 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTN1O94822 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LTN1O94822 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
LTN1O94822 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTN1O94822 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LTN1O94822 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LTN1O94822 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LTN1O94822 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LTN1O94822 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LTN1O94822 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LTN1O94822 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LTN1O94822 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LTN1O94822 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LTN1O94822 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LTN1O94822 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LTN1O94822 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
LTN1O94822 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LTN1O94822 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LTN1O94822 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LTN1O94822 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LTN1O94822 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LTN1O94822 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LTN1O94822 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
LTN1O94822 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LTN1O94822 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LTN1O94822 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LTN1O94822 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LTN1O94822 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LTN1O94822 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
LTN1O94822 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LTN1O94822 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
LTN1O94822 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LTN1O94822 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
LTN1O94822 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LTN1O94822 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LTN1O94822 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LTN1O94822 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
LTN1O94822 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LTN1O94822 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LTN1O94822 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LTN1O94822 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LTN1O94822 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LTN1O94822 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
LTN1O94822 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LTN1O94822 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LTN1O94822 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTN1O94822 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTN1O94822 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LTN1O94822 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LTN1O94822 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LTN1O94822 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LTN1O94822 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LTN1O94822 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LTN1O94822 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LTN1O94822 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
LTN1O94822 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LTN1O94822 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LTN1O94822 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LTN1O94822 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LTN1O94822 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LTN1O94822 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LTN1O94822 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LTN1O94822 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LTN1O94822 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LTN1O94822 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LTN1O94822 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LTN1O94822 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LTN1O94822 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LTN1O94822 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTN1O94822 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTN1O94822 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTN1O94822 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTN1O94822 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LTN1O94822 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LTN1O94822 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LTN1O94822 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LTN1O94822 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LTN1O94822 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LTN1O94822 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LTN1O94822 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms