Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DTNBO60941 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DTNBO60941 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DTNBO60941 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DTNBO60941 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DTNBO60941 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DTNBO60941 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DTNBO60941 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DTNBO60941 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DTNBO60941 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DTNBO60941 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DTNBO60941 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DTNBO60941 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DTNBO60941 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DTNBO60941 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DTNBO60941 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DTNBO60941 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DTNBO60941 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DTNBO60941 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DTNBO60941 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DTNBO60941 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DTNBO60941 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DTNBO60941 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DTNBO60941 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DTNBO60941 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DTNBO60941 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DTNBO60941 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DTNBO60941 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DTNBO60941 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DTNBO60941 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DTNBO60941 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DTNBO60941 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DTNBO60941 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DTNBO60941 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DTNBO60941 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DTNBO60941 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DTNBO60941 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DTNBO60941 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DTNBO60941 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DTNBO60941 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DTNBO60941 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DTNBO60941 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DTNBO60941 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DTNBO60941 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DTNBO60941 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DTNBO60941 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DTNBO60941 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DTNBO60941 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DTNBO60941 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DTNBO60941 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DTNBO60941 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DTNBO60941 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DTNBO60941 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DTNBO60941 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DTNBO60941 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DTNBO60941 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DTNBO60941 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DTNBO60941 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DTNBO60941 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DTNBO60941 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DTNBO60941 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DTNBO60941 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DTNBO60941 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DTNBO60941 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DTNBO60941 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DTNBO60941 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DTNBO60941 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DTNBO60941 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DTNBO60941 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DTNBO60941 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DTNBO60941 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DTNBO60941 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DTNBO60941 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DTNBO60941 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DTNBO60941 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DTNBO60941 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DTNBO60941 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DTNBO60941 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DTNBO60941 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DTNBO60941 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DTNBO60941 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DTNBO60941 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DTNBO60941 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DTNBO60941 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DTNBO60941 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DTNBO60941 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DTNBO60941 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DTNBO60941 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DTNBO60941 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DTNBO60941 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DTNBO60941 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DTNBO60941 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DTNBO60941 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DTNBO60941 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DTNBO60941 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DTNBO60941 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DTNBO60941 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DTNBO60941 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DTNBO60941 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DTNBO60941 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms