Protein–RNA interactions for Protein: O00327

ARNTL, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTLO00327 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARNTLO00327 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ARNTLO00327 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARNTLO00327 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms