Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms