Protein–RNA interactions for Protein: F8VZ95

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VZ95 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
F8VZ95 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
F8VZ95 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
F8VZ95 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F8VZ95 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
F8VZ95 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F8VZ95 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
F8VZ95 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
F8VZ95 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
F8VZ95 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
F8VZ95 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VZ95 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F8VZ95 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
F8VZ95 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
F8VZ95 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F8VZ95 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
F8VZ95 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VZ95 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VZ95 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VZ95 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VZ95 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VZ95 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VZ95 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VZ95 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VZ95 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VZ95 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F8VZ95 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F8VZ95 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F8VZ95 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F8VZ95 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F8VZ95 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F8VZ95 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
F8VZ95 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F8VZ95 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
F8VZ95 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
F8VZ95 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
F8VZ95 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
F8VZ95 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
F8VZ95 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
F8VZ95 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
F8VZ95 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
F8VZ95 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
F8VZ95 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
F8VZ95 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
F8VZ95 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
F8VZ95 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
F8VZ95 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
F8VZ95 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
F8VZ95 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
F8VZ95 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
F8VZ95 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
F8VZ95 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
F8VZ95 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
F8VZ95 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
F8VZ95 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
F8VZ95 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
F8VZ95 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
F8VZ95 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
F8VZ95 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
F8VZ95 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
F8VZ95 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VZ95 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VZ95 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VZ95 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VZ95 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
F8VZ95 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
F8VZ95 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
F8VZ95 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
F8VZ95 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
F8VZ95 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
F8VZ95 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
F8VZ95 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
F8VZ95 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
F8VZ95 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
F8VZ95 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
F8VZ95 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
F8VZ95 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
F8VZ95 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
F8VZ95 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
F8VZ95 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
F8VZ95 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VZ95 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VZ95 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VZ95 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VZ95 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VZ95 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VZ95 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms