Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4DGG1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4DGG1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4DGG1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
B4DGG1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4DGG1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4DGG1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4DGG1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4DGG1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4DGG1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4DGG1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4DGG1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4DGG1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4DGG1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4DGG1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4DGG1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4DGG1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4DGG1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4DGG1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4DGG1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4DGG1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4DGG1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4DGG1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4DGG1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4DGG1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4DGG1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4DGG1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4DGG1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4DGG1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4DGG1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4DGG1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4DGG1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4DGG1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4DGG1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4DGG1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4DGG1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
B4DGG1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
B4DGG1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4DGG1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4DGG1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4DGG1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4DGG1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
B4DGG1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
B4DGG1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4DGG1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4DGG1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4DGG1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4DGG1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4DGG1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4DGG1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4DGG1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
B4DGG1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
B4DGG1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4DGG1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4DGG1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4DGG1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4DGG1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4DGG1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4DGG1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4DGG1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4DGG1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4DGG1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4DGG1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4DGG1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4DGG1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4DGG1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4DGG1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4DGG1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4DGG1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4DGG1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4DGG1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4DGG1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4DGG1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4DGG1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4DGG1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4DGG1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4DGG1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DGG1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4DGG1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4DGG1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
B4DGG1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4DGG1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
B4DGG1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4DGG1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4DGG1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4DGG1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4DGG1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4DGG1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms