Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP17L4A6NCW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP17L4A6NCW7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP17L4A6NCW7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
USP17L4A6NCW7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms