Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LCHNA4D1U4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LCHNA4D1U4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms