Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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