Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A4Q9Y6R1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A4Q9Y6R1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A4Q9Y6R1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1598 ms