Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YIPF1Q9Y548 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YIPF1Q9Y548 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
YIPF1Q9Y548 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YIPF1Q9Y548 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YIPF1Q9Y548 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YIPF1Q9Y548 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
YIPF1Q9Y548 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
YIPF1Q9Y548 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YIPF1Q9Y548 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
YIPF1Q9Y548 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YIPF1Q9Y548 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YIPF1Q9Y548 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
YIPF1Q9Y548 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
YIPF1Q9Y548 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
YIPF1Q9Y548 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
YIPF1Q9Y548 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YIPF1Q9Y548 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YIPF1Q9Y548 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YIPF1Q9Y548 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YIPF1Q9Y548 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
YIPF1Q9Y548 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
YIPF1Q9Y548 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
YIPF1Q9Y548 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YIPF1Q9Y548 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms