Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.38■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC49.36■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC49.36■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC49.36■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC49.36■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC49.36■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC49.35■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC49.34■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC49.34■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC49.32■■■■■ 5.49
DCAF1Q9Y4B6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC49.31■■■■■ 5.48
DCAF1Q9Y4B6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
DCAF1Q9Y4B6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC49.31■■■■■ 5.48
DCAF1Q9Y4B6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC49.31■■■■■ 5.48
DCAF1Q9Y4B6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC49.31■■■■■ 5.48
DCAF1Q9Y4B6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
DCAF1Q9Y4B6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC49.29■■■■■ 5.48
DCAF1Q9Y4B6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.29■■■■■ 5.48
DCAF1Q9Y4B6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC49.28■■■■■ 5.48
DCAF1Q9Y4B6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
DCAF1Q9Y4B6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
DCAF1Q9Y4B6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC49.25■■■■■ 5.47
DCAF1Q9Y4B6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC49.24■■■■■ 5.47
DCAF1Q9Y4B6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
DCAF1Q9Y4B6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
DCAF1Q9Y4B6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
DCAF1Q9Y4B6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC49.22■■■■■ 5.47
DCAF1Q9Y4B6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC49.22■■■■■ 5.47
DCAF1Q9Y4B6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
DCAF1Q9Y4B6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
DCAF1Q9Y4B6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC49.19■■■■■ 5.47
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.17■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC49.17■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.17■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.16■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.15■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC49.15■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC49.15■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC49.15■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC49.15■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
DCAF1Q9Y4B6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC49.13■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.13■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC49.13■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC49.11■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC49.09■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC49.09■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC49.09■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC49.08■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC49.08■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC49.08■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC49.07■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC49.07■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
DCAF1Q9Y4B6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC49.04■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC49.04■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC49.04■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC49.03■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC49.03■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC49.03■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
DCAF1Q9Y4B6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC48.99■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC48.99■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC48.99■■■■■ 5.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms