Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FCF1Q9Y324 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FCF1Q9Y324 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FCF1Q9Y324 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCF1Q9Y324 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms