Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFSF13BQ9Y275 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFSF13BQ9Y275 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFSF13BQ9Y275 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFSF13BQ9Y275 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFSF13BQ9Y275 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFSF13BQ9Y275 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
TNFSF13BQ9Y275 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFSF13BQ9Y275 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFSF13BQ9Y275 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNFSF13BQ9Y275 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNFSF13BQ9Y275 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFSF13BQ9Y275 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFSF13BQ9Y275 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFSF13BQ9Y275 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFSF13BQ9Y275 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFSF13BQ9Y275 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFSF13BQ9Y275 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFSF13BQ9Y275 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFSF13BQ9Y275 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFSF13BQ9Y275 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFSF13BQ9Y275 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms