Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms