Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
MED23Q9ULK4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
MED23Q9ULK4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MED23Q9ULK4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MED23Q9ULK4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MED23Q9ULK4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms