Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HDAC9Q9UKV0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
HDAC9Q9UKV0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
HDAC9Q9UKV0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms