Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDRG3Q9UGV2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDRG3Q9UGV2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms