Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDP2Q9P2J9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDP2Q9P2J9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms