Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCHIP1Q9P0W5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCHIP1Q9P0W5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms