Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWZ3

IRAK4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK4Q9NWZ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IRAK4Q9NWZ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRAK4Q9NWZ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRAK4Q9NWZ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRAK4Q9NWZ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms