Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TCP11L1Q9NUJ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TCP11L1Q9NUJ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCP11L1Q9NUJ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms