Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCND1Q9NSA2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KCND1Q9NSA2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms