Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ACKR4Q9NPB9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACKR4Q9NPB9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR4Q9NPB9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR4Q9NPB9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms