Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BPIFA1Q9NP55 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BPIFA1Q9NP55 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BPIFA1Q9NP55 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BPIFA1Q9NP55 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BPIFA1Q9NP55 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BPIFA1Q9NP55 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA1Q9NP55 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA1Q9NP55 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA1Q9NP55 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA1Q9NP55 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPIFA1Q9NP55 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BPIFA1Q9NP55 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BPIFA1Q9NP55 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms