Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
OPA3Q9H6K4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPA3Q9H6K4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPA3Q9H6K4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms