Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH19Q9H159 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH19Q9H159 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH19Q9H159 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH19Q9H159 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH19Q9H159 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH19Q9H159 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH19Q9H159 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH19Q9H159 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH19Q9H159 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH19Q9H159 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms