Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDEM3Q9BZQ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM3Q9BZQ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDEM3Q9BZQ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
EDEM3Q9BZQ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms