Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRI1Q9BV20 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRI1Q9BV20 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRI1Q9BV20 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRI1Q9BV20 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRI1Q9BV20 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRI1Q9BV20 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms