Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A3Q9BRY0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A3Q9BRY0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms