Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC3Q9BQ90 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC3Q9BQ90 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC3Q9BQ90 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC3Q9BQ90 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC3Q9BQ90 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC3Q9BQ90 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC3Q9BQ90 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC3Q9BQ90 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHDC3Q9BQ90 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC3Q9BQ90 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC3Q9BQ90 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC3Q9BQ90 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC3Q9BQ90 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC3Q9BQ90 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC3Q9BQ90 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC3Q9BQ90 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC3Q9BQ90 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC3Q9BQ90 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms