Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CGREF1Q99674 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGREF1Q99674 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGREF1Q99674 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms