Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DEPDC7Q96QD5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DEPDC7Q96QD5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEPDC7Q96QD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms