Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ALS2Q96Q42 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ALS2Q96Q42 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ALS2Q96Q42 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ALS2Q96Q42 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms