Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
COG3Q96JB2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
COG3Q96JB2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
COG3Q96JB2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
COG3Q96JB2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms