Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PGBD4Q96DM1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD4Q96DM1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PGBD4Q96DM1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms